个人简介
石瑊，男，重庆医科大学特聘副教授（青年创新人才），2025年入职。博士毕业于哈尔滨医科大学，曾于中山大学从事博士后研究工作。
长期致力于基于生物组学大数据解析肿瘤免疫微环境、非编码RNA异常调控以及表观遗传改变在重大疾病发生发展中的作用机制，聚焦肿瘤分子标志物的挖掘与功能研究，服务于临床早期诊断与个体化用药策略的开发。以第一作者、共一作者或通讯作者身份在Nucleic Acids Research、Journal of Translational Medicine、Scientific Reports、Frontiers in Genetics等国际期刊发表SCI论文6篇，累计影响因子超过50，总引用次数超过120。
教育背景及工作经历
2010-2015哈尔滨医科大学生物技术(生物医学软件工程方向)理学学士
2015-2018哈尔滨医科大学生物信息理学硕士
2018-2021哈尔滨医科大学生物医学工程医学博士
2021-2024中山大学附属第一医院博士后研究
主持以及参与科研项目
1.国家自然科学基金青年科学基金项目:基于单细胞多组学数据解析影响肿瘤亚克隆谱系分化的调控元件, NO:32300543, 24.01-26.12, 30万,主持。
2.中山大学中央高校基础科研专项资助:基于单细胞时序测序数据探索食管癌患者个体耐药机制, 22.01~22.12, 10.8万,主持。
3.国家自然科学基金:基于单细胞DNA数据的肿瘤轨迹追踪及适应性机制研究, NO:32270699, 23.01~26.12, 54万,参与。
4.国家自然科学基金:基于单细胞测序数据解析介导癌症转移的关键免疫-肿瘤细胞间互作及其功能机制, NO: 82173321, 22.01~25.12, 54.7万,参与
5.国家自然科学基金:基于功能性解析系统发生树识别驱动癌症演化的关键基因及其功能研究, NO: 32170675, 22.01~25.12, 58万,参与
代表性论文、专利
1.Jian Shi#,Li Wang#,Xiangzhe Yin#,Lixia Wang,Lin Bo,Kailai Liu,Ke Feng,Shihua Lin,Yanjun Xu*,Shangwei Ning*,Hongying Zhao*. Comprehensive characterization of clonality of driver genes revealing their clinical relevance in colorectal cancer. Journal of Translational
Medicine, 2022 Aug;12;20(1):362.doi: 10.1186/s12967-022-03529-x.
2.Jian Shi#*,Yanru Zhang#,Lixia Xu,Fang Wang*. Single-cell transcriptomics reveals tumor microenvironment remodeling in hepatocellular carcinoma with varying tumor subclonal complexity. Frontiers in genetics, 2024 Aug 29:15:1467682.doi: 10.3389/fgene.2024.1467682. eCollection 2024.
3.Hongying Zhao#,Jian Shi#,Yunpeng Zhang#,Aimin Xie,Lei Yu,Caiyu Zhang,Junjie Lei,Haotian Xu,Zhijun Leng,Tengyue Li,Waidong Huang,Shihua Lin,Li Wang*,Yun Xiao*,Xia Li*. LncTarD: a manually-curated database of experimentally-supported functional lncRNA–target regulations in human diseases. Nucleic Acids Res. 2020 Jan 8;48(D1):D118-D126.doi: 10.1093/nar/gkz985.
4.Guanxiong Zhang#,Jian Shi#,Shiwei Zhu#,Yujia Lan,Liwen Xu,Huating Yuan,Gaoming Liao,Xiaoqin Liu,Yunpeng Zhang*,Yun Xiao*,Xia Li* DiseaseEnhancer: a resource of human disease-associated enhancer catalog. Nucleic Acids Res 2018 Jan 4;46(D1):D78-D84.doi: 10.1093/nar/gkx920.
5.Li Wang#,Lei Yu#,Jian Shi#,Feng Li#,Caiyu Zhang,Haotian Xu,Xiangzhe Yin,Lixia Wang,Shihua Lin,Anastasiia Litvinova,Yanyan Ping*,Shangwei Ning*,Hongying Zhao*. Functional regulations between genetic alteration-driven genes and drug target genes acting as prognostic biomarkers in breast cancer. Sci Rep. 2022 Jun 23;12(1):10641.doi: 10.1038/s41598-022-13835-5.
